MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p4

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021989	AGG	2	6	752	757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021989	A	6	6	1493	1498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021989	AGC	2	6	1512	1517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021989	A	6	6	1523	1528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021989	A	6	6	1615	1620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021989	AAG	2	6	1650	1655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021989	AG	3	6	1739	1744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021989	TAAC	2	8	1787	1794	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021989	ATT	2	6	2285	2290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021989	A	6	6	2326	2331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021989	TTTAT	2	10	2336	2345	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021989	AC	3	6	2349	2354	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021989	TAAAA	2	10	2355	2364	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021989	A	6	6	2375	2380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021989	CT	3	6	2788	2793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021989	T	6	6	2793	2798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021989	CAC	2	6	5604	5609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_021989	TATT	2	8	5613	5620	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021989	TC	3	6	5631	5636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021989	AAT	2	6	5652	5657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021989	TAA	2	6	5662	5667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021989	AGG	2	6	5670	5675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021989	A	6	6	5956	5961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021989	T	6	6	5971	5976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021989	T	7	7	6048	6054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021989	AAC	2	6	7571	7576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021989	GATT	2	8	7620	7627	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021989	A	6	6	7636	7641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021989	AG	3	6	8533	8538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021989	T	7	7	8556	8562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021989	CTT	2	6	8591	8596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021989	AAG	2	6	8645	8650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021989	CCT	2	6	8683	8688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_021989	TTA	2	6	8721	8726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021989	A	6	6	8733	8738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021989	TG	3	6	8746	8751	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021989	GTT	2	6	8779	8784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021989	CCT	2	6	8887	8892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_021989	AAC	2	6	8898	8903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021989	GGA	2	6	9023	9028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021989	T	6	6	9040	9045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021989	TAA	3	9	9106	9114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021989	AGTA	2	8	9143	9150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021989	G	6	6	9209	9214	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.